Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab11fip3Q8CHD8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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