Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hpf1Q8CFE2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms