Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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Usp27Q8CEG8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Usp27Q8CEG8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Usp27Q8CEG8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Usp27Q8CEG8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Usp27Q8CEG8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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