Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc17Q8CE13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc17Q8CE13 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms