Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc63Q8CDV6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc63Q8CDV6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms