Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufl1Q8CCJ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms