Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf2Q8CB19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phtf2Q8CB19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.4 ms