Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nhsl1Q8CAF4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nhsl1Q8CAF4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nhsl1Q8CAF4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms