Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc113Q8C5T8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc113Q8C5T8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms