Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TnrQ8BYI9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TnrQ8BYI9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms