Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx1bQ8BX32 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slx1bQ8BX32 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slx1bQ8BX32 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slx1bQ8BX32 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slx1bQ8BX32 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slx1bQ8BX32 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slx1bQ8BX32 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slx1bQ8BX32 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms