Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Usp38Q8BW70 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Usp38Q8BW70 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Usp38Q8BW70 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp38Q8BW70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Usp38Q8BW70 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Usp38Q8BW70 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Usp38Q8BW70 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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