Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp54Q8BL06 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp54Q8BL06 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms