Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJI1

Slc6a17, Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a17Q8BJI1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a17Q8BJI1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a17Q8BJI1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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