Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Timm29Q8BGX2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Timm29Q8BGX2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms