Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
U2af1l4Q8BGJ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms