Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htatsf1Q8BGC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms