Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc3Q8BG54 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc3Q8BG54 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms