Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca2Q8BG22 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca2Q8BG22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca2Q8BG22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms