Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem39bQ810L4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms