Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prima1Q810F0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prima1Q810F0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prima1Q810F0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prima1Q810F0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms