Protein–RNA interactions for Protein: Q80YX1

Tnc, Tenascin, mousemouse

Predictions only

Length 2,110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TncQ80YX1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TncQ80YX1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms