Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bQ80YF6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bQ80YF6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms