Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Zbed4Q80WQ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed4Q80WQ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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