Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Ell3Q80VR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ell3Q80VR2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ell3Q80VR2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ell3Q80VR2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ell3Q80VR2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ell3Q80VR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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