Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Aldh3b1Q80VQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms