Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Clasp1Q80TV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clasp1Q80TV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms