Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfsf18Q7TS55 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms