Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms