Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp397Q7TNK4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms