Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd1l2Q7TN88 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms