Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf2Q7TMI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms