Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tigd3Q7TM95 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tigd3Q7TM95 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms