Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eci3Q78JN3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms