Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nme8Q715T0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms