Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynmQ70IV5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynmQ70IV5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms