Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35Q6ZWV7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms