Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnih3Q6ZWS4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms