Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup188Q6ZQH8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms