Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Topbp1Q6ZQF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Topbp1Q6ZQF0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms