Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc44a1Q6X893 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc44a1Q6X893 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms