Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P4ha3Q6W3F0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P4ha3Q6W3F0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms