Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rhox8Q6VSS7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rhox8Q6VSS7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Rhox8Q6VSS7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms