Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ift172Q6VH22 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift172Q6VH22 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms