Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja6Q6S5G4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja6Q6S5G4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms