Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sort1Q6PHU5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms