Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab35Q6PHN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms