Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms