Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc85bQ6PDY0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms