Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sarm1Q6PDS3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sarm1Q6PDS3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms